氣相色譜儀（GC）和氣相色譜質譜聯用儀分析化合物時，有時候會遇到色譜峰拖尾的問題，根據拖尾的現象，可以分為：
（1）低濃度的組分正常，高濃度的組分拖尾；
（2）極性化合物拖尾；
（3）早流出的組分拖尾；
（4）晚流出的組分拖尾；
（5）所有組分拖尾；
如果氣相色譜峰拖尾，一般是氣相色譜儀的原因，與質譜儀或氣相色譜儀檢測器的關系不大，主要從以下幾個方面分析：
樣品的問題
1、樣品濃度太高
樣品濃度太高時，樣品的色譜峰就會有明顯的拖尾，這種情況下可以稀釋樣品，或者把樣品進樣的模式由不分流進樣改為分流進樣，或者把分流進樣的分流比調高一些，例如之前設置進樣分流比為10:1，根據樣品的實際濃度可以設置為100:1等。
2、樣品的性質問題
①化合物極性太強
分析極性化合物或活性化合物時，其活性位點容易與流經途中的位點吸附而呈現出拖尾，這種情況下要求樣品分析系統具有良好的惰性，例如使用超惰的襯管、干凈的分流平板和惰性好的低流失色譜柱。
②化合物的沸點太低
早流出的組分一般是揮發性強、沸點低的組分，這類化合物拖尾嚴重時，主要原因在于化合物的沸點太低，可能在于溶劑聚焦效應不夠，溶劑沒有冷凝、有部分氣化時，樣品就進入了色譜柱，這樣沸點低的化合物也就先進入色譜柱進行分析了，導致色譜峰拖尾。這種情況下可以降低進樣口的溫度、調整程序升溫的初始溫度在溶劑沸點10-25℃以下，讓所有的化合物都在冷凝的情況下，整齊劃一地進入色譜柱。
③化合物的沸點太高
晚流出的色譜峰一般是低揮發性、沸點高的組分，這類化合物的拖尾現象隨著保留時間的增加而嚴重，主要原因在于化合物的沸點太高，在進樣口氣化不，或者色譜柱和傳輸線的溫度偏低，引起樣品在分析的過程中有部分冷凝，進而導致色譜峰拖尾。這種情況下，應該注意化合物的沸點，可以適當地提高進樣口、色譜柱、傳輸線等處的溫度可以改善拖尾現象。
進樣口的問題
1、進樣口的溫度不合適
樣品使用氣相色譜儀分離時，首先進入進樣口，在里面進行氣化，所以要求進樣口的溫度要高于待測化合物的沸點，使化合物在進樣口處充分氣化。如果進樣口的溫度低于待測化合物的沸點，那么化合物就會氣化不充分，也會導致色譜峰拖尾。并且，沒有氣化的化合物就會殘留在進樣口，污染進樣隔墊和襯管，也可能響到其它化合物的峰形。高溫有利用樣品的氣化，同時，也要考慮到樣品的熱穩定性，要保證樣品在高溫下不改變化學性質。
使用氣相色譜儀分離化合物，利用新的隔墊、襯管和柱子時，化合物的分離度和峰形都很好。使用一段時間后，化合物的峰形明顯拖尾，這種情況下的主要原因就是進樣口和色譜柱有污染。
2、隔墊和襯管被污染
進樣口很容易被污染的兩個部位就是隔墊和襯管。隔墊和襯管被污染后，化合物有可能與污染物結合或者發生反應，也會導致峰拖尾。這時候更換新的隔墊和襯管就會解決峰拖尾的問題。針對很容易拖尾的化合物，可以選擇使用超惰性的襯管，不容易與化合物發生反應，有利于化合物的分離分析。必要時，還可以清洗一下襯管下面的分流平板。
色譜柱的問題
1、色譜柱的類型問題
所使用的氣相色譜柱不適合樣品的分析，如果樣品是極性的，使用了非極性或者弱極性的色譜柱，這種情況下色譜峰拖尾會很嚴重，這時候需要把色譜柱換成極性或者強極性的色譜柱就可以了。
2、色譜柱沒有安裝到位
色譜柱安裝在進樣口端是有長度要求的，一般安捷倫的色譜儀要求色譜柱露出進樣口的柱螺母4-6mm，使用EI源要求露出質譜端1-2mm，使用CI源要求露出質譜端0-1mm；另外，不同的襯管對色譜柱的露出長度也會有不同的要求。如果色譜柱露出柱螺母太長，會阻礙樣品迅速進入色譜柱，因而導致峰拖尾。毛細管柱伸入到氣相色譜儀檢測器FID/NFD/FPD等噴嘴距離太短，也有可能導致峰拖尾。
3、色譜柱的溫度
色譜柱的溫度是通過設置柱溫箱的溫度來控制的，合適的溫度可以得到良好的分離度和峰形圖。氣相色譜儀一般都采用程序升溫的方法來分離化合物，程序升溫的起始溫度要求低于流出的化合物沸點，對于低沸點的化合物可以設置程序升溫的初始溫度在溶劑沸點10-25℃以下。高沸點的化合物出現拖尾，可以適當提高該化合物出峰時的溫度。
4、色譜柱有污染
如果一根色譜柱最開始分析樣品的色譜峰都是正常的，使用一段時間后，發現色譜峰明顯拖尾，這種情況下有可能就是色譜柱有污染。色譜柱被污染后，柱效就會下降，就會導致色譜峰拖尾。
解決方法
步：清洗色譜柱
可以使用極性的有機溶劑甲醇和非極性的有機溶劑正己烷，交替進入氣相色譜儀中，不運行質譜檢測器，讓有機溶劑清洗色譜柱。
第二步：老化色譜柱
設置柱溫箱的溫度高于色譜方法中的溫度，低于色譜柱的耐受溫度，保持3-4小時，然后再次檢測樣品，觀察色譜峰是否有改善。
第三步：截掉色譜柱
再使用了步和第二步后，色譜峰拖尾的問題改善不是很明顯的情況下，可以把接在進樣口端的色譜柱截掉至少20厘米。色譜柱被污染，大部分的污染物會集中在進樣口端，所以可以把進樣口端的色譜柱截掉至少20厘米；如果污染嚴重的話，截掉長度可以更長一些。