峰分離不完全
1、色譜峰之間發生重疊，分離不開：可以通過減小進樣量，降低柱子升溫速率來進行解決；
對于原來能完全分離的組分，過一段時間后分離效果不好，很有可能色譜柱柱效下降，此時可通過老化色譜柱，除去柱中難揮發與半揮發性雜質，還有可能是色譜柱固定液流失嚴重，壽命已終，需要更換色譜柱。
2、分離時間太長導致晚餾出的峰平：升高色譜柱溫度進行解決。
3、樣品不出峰，含量少的組分檢測不出來：有可能是色譜柱安裝不正確，需重新安裝色譜柱，并對儀器系統進行檢漏；進樣針發生堵塞；色譜柱和進樣口溫度太低；還有可能是檢測器靈敏度低，可通過增加進樣量，提高檢測器的靈敏度。
峰形不規則
拖尾峰：進樣口和色譜柱發生污染，需要對氣相進樣口進行清洗和維護，比如更換或清洗襯管；通過對色譜柱進行老化除去污染物，或者從柱進口端截去1-2圈，再重新安裝。
前沿峰：進樣量太大導致色譜柱過載，需減小進樣量；樣品組分發生冷凝，需提高色譜柱和進樣口溫度。
平頂峰：可以通過減小進樣量、升高載氣流速和柱溫來進行解決。當信號放大器輸入飽和、色譜柱過載時會形成平頂峰。
檢測器對分析結果的影響
以熱導檢測器TCD為例，其檢測原理主要是利用載氣和被測組分氣體熱導率的不同，檢測橋路中所形成的不平衡電壓與待測組分濃度成正比，從而實現對樣品組分的定量分析。
1、基線漂移（或出現階型基線）、噪聲偏高：檢測器發生污染，需進行清洗和維護。
2、基線降為零點：TCD熱阻絲發生斷裂。
3、脈沖干擾峰：可能是TCD電源電壓供應不穩定，需檢查供應電源。
載氣因素
與液相分析不同的是，氣相是以氣體作為流動相，載氣攜帶樣品組分流經固定相，經過不斷的吸附解吸，隨載氣先后流出色譜柱，到達檢測器被檢測。在此過程中載氣的流速、氣路管道的密封性、載氣壓力也會影響色譜的分離效能。
1、載氣流速偏低：會造成保留時間延長、靈敏度降低、拖尾峰、圓頂峰。
2、載氣流速過高：會引起基線漂移、噪聲偏高。
針對上述情況，需要檢查減壓閥是否超出使用范圍，必要時需進行更換，同時檢測氣路密閉性。
電路問題
如果基線出現正弦波，很大可能是由于放大電路發生故障。
當電源不能正常啟動、柱溫箱和進樣口不能加熱，一般也是由于電路出現故障。
針對以上情況，可以通過更換損壞的電子元件進行解決。
FID檢測器點火失敗
首先需要確認氫氣和空氣是否打開，點火線圈是否完好；除此之外，檢查色譜柱與檢測器端是否漏氣。
倒峰
出現倒峰，需要檢查儀器的主機或處理機是否接反