毛刺是因信號頻率的波動而引起，是比色譜峰的有效值頻率更高的基線擾動。毛刺的存在并不影響色譜峰的分辨，規則的毛刺還算是正常,但毛刺過大對檢測限有一定影響。
國產氣相色譜儀基線出現很多的毛刺，先給儀器充分的穩定時間再看看。如果還是有毛刺可能是色譜系統出了問題，一般是一下幾個方面的問題
1.氫氣，空氣，載氣純度不高會影響
2.玻璃襯管是否臟
3.色譜柱是否臟，處理一下或換一個新的試一試
4.檢測器清洗一下，可能有未燃燒完的雜質
5.是否漏氣
6.進樣口是否該換一個墊子
7.氣相色譜儀是否產生較大振動
8.信號接收器是否已懷或者接觸不良
9.因工作站出問題導致的毛刺