棒狀薄層色譜儀點樣方式、點樣量及點樣設備的選擇決定于分析的目的、樣品溶液的濃度及被測物質的檢出靈敏度。
在棒狀薄層色譜儀分析中點樣是造成TLC定量誤差的主要來源。譜析儀器通過試驗可以認為定量毛細管較適合較小體積的點樣；進樣器適合較大體積的點樣。這主要是因為進樣器受小氣泡、溶液回爬現象的影響較大。為避 免不同定量毛細管間的點樣誤差、建議一整塊的棒狀薄層色譜柱上用同一只定量毛細管。但應注意在換樣品時，應將毛細管用超聲波或不同極性溶劑清洗干凈。在制備樣品時，溶樣溶劑黏度不能過高，以便于點樣；溶劑沸點過低則進樣體積易變，過高則會改變展開劑組成。較好TLC樣點的原點一般底邊距1～5cm。
棒狀薄層色譜儀點樣操作
控制室內溫度不可高于17℃，用1 μL微量注射器吸取配好的油樣，在置于坐標紙上的色譜棒掃描前端1.2 cm處點樣，每次點樣后需干燥后繼續進行，控制在5～8次，每次點樣在色譜棒上的擴散距離不超過2 mm，點樣完成后放入裝有飽和 NaOH溶液的恒濕缸中10 min。
