國產氣相色譜儀出反峰指大部分峰為正向出峰，但一部分峰為反向出峰，或基線往負方向偏移。
A.使用空氣壓縮機時，檢查確認反向出峰或基線往負方向偏移是否與空氣壓縮機的動作(空氣壓力不足時空氣壓縮機自動動作)在時間上是否同步。
B.較多水份進入離子化檢測器時，火焰的燃燒狀態短時間會起變化，伴隨出現反峰(這不是異常)。
C.檢查各種氣體的流量設置是否正常，以及是否存在漏氣現象。
D.檢查載氣的純度，如果載氣里面有微量不純物，而樣品的純度如果比載氣的純度高，就會出反峰。
E.氣路切換時有壓力沖擊，也會出現反峰，此時氣路中應加接穩壓裝置。
F.使用TCD時，如果載氣和樣品的熱導系數過于接近，也會出現一部分或全部的反峰。
