隔墊吹掃，又叫膈膜吹掃。主要是對氣相色譜儀進樣墊的吹掃氣，隔墊吹掃就是在氣相色譜儀進樣口隔墊下有一股氣流橫向吹掃，這樣做是為了把高溫下隔墊的揮發物從隔墊吹掃出口放空，以避免色譜柱進入這些隔墊揮發物質，大大減少了隔墊流失物和隔墊上的吸附物所產生的干擾。
因為在毛細管分析中，對樣品含量及雜質要求較嚴格。而進樣墊又在進樣口位置。一般溫度都在150度以上。所以進樣墊（普遍是橡膠類的，好的有一層聚四氟乙烯膜）會有有機物質等揮發出來。而回發出來的物質就會進入汽化室，進而污染氣相色譜儀系統對分析結果會有較大影響。所以要把這些物質吹到色譜系統外面去。所以進樣墊下面有一個吹掃氣來將揮發物質吹走。這個就是隔墊吹掃氣流。隔墊吹掃氣流普遍為3~5ml/min就可以。
隔墊吹掃其作用主要有二個：a、消除進樣時可能帶入的雜質 b、消除進樣口密封墊在高溫時釋放出的雜質。
