國產氣相色譜儀載氣如果不純會造成以下問題
（1）進樣口：樣品易氧化，造成樣品分解，出現鬼峰等；
（2）色譜柱：色譜柱內填料易氧化，縮短柱使用壽命；
（3）TCD：熱敏元件(錸鎢絲)易氧化，縮短檢測器使用壽命；
（4）FID：噪聲大，基線不穩定；
（5）ECD：基線滿量程，無法調零；其原因：ECD控制器一般都采用“調制脈沖”供電方式，當設定好預置電流（0.5、1、2nA）后，ECD控制器將發出脈沖電平，使通過檢測器內的載氣被放射源電離的形成電子，在收集脈沖的作用下，在運算放大器輸入端進行減法運算，直至輸出為零，如果載氣純度不夠（主要是含氧量過高），載氣被放射源電離的形成電子流偏低，與設定預置電流不能抵消為零，就會造成運算放大器（積分運算放大器）輸出飽和；無法調零。
（6）FPD：噪聲大，基線不穩定；
（7）NPD：噪聲大，基線不穩定；
國產氣相色譜儀分析時，當發現氣體（載氣和輔助氣）純度不夠，而影響譜圖分析時，應及時更換為高純度的氣體，以免造成不必要的損失。
