毛細管色譜柱的老化是氣相色譜儀應用的一項常見工作，老化柱子的時間主要還是要根據測定的樣品來判斷。如果經常性的使用儀器，那么就可以定為一到兩個星期老化一次，老化時間也不用太長，可以直接升到老化溫度，半個小時左右足夠了。如果是長時間使用的色譜柱，并且色譜柱進樣品端已經黑了，那就要系統老化。截去進樣口端0.5米的長度，再以5度/分鐘的速率升到老化溫度，保持20-30分鐘后再降溫到初始，再以5度/分鐘的速率升到老化溫度這樣循環兩次。必要的時候要進行清洗和再生。
老化柱子的好處：是徹底除去填充物中的殘留溶劑和某些揮發性的物質；另一方面是促進固定液均勻牢固地分布在擔體的表面上，降低由于柱子流失而引起的本底噪聲，讓色譜柱為即將進行的分析做好準備。通常，新柱初次使用、色譜柱放置一段時間后再次使用、或色譜柱受到一定污染或損傷后都需要進行適當的老化。
