氣相色譜儀常使用的氣體種類為氫氣、氮氣和空氣，隨著人們對實驗的安全和高效越來越重視，實驗室供氣系統也發生著轉變，三種氣體可以為鋼瓶氣（氮氣鋼瓶、氫氣鋼瓶和凈化空氣鋼瓶），也可以是氣體發生器（氫氣、氮氣氣體發生器和全自動空氣源）。
氣相色譜儀鋼瓶氣
當使用鋼瓶氣時，應在室外有獨立的鋼瓶室，鋼瓶室的房蓋應活動、易被掀起。由于鋼瓶不易運輸，使用氣體鋼瓶在當地或較為便利的地方購買，為以后換氣方便。所需氣體及純度、壓力要求如下：所需氣體及對氣體的要求
氣體 儀器入口壓力 純度
載氣（氮、氫或氦氣） 0．40MPa 99．999％
氫氣 0．30MPa 99．999％
空氣 0．40MPa 無油干燥
氣相色譜儀氣體發生器
當使用氮氣、氫氣發生器和全自動空氣源時，要放在儀器附近2 米以內，設置空間為1 平米，放在實驗臺上或地上都可以。
氣體發生器與瓶裝氣源相比各有優缺點：
1) 高壓氣體鋼瓶最大的優點是供氣可靠，但用完后需采購或更換氣瓶較為麻煩，而且作為高壓容器（尤其是氫氣）在使用安全上不能疏忽。
2) 氣體發生器的最大優點是使用方便、安全。但作為一種儀器免不了有時會出現一些故障；所以，與瓶裝氣相比其供氣可靠性要差一些。氣體發生器、可以連續地制備氣體，因此無需將氣體儲存在容器中，由此也避免了發生泄露等安全隱患。
