氣相色譜儀基線波動、漂移是一個基線問題，可能會增加測量誤差，有時甚至會導致儀器故障。
(1)遇到基線問題時，首先檢查儀器條件是否已更改，以及是否新更換了新的氣瓶和設備附件。
(2)如果有變化或條件發生變化，有必要檢查基線問題是否是由這些變化引起的。通常，這種變化通常是導致基線問題的原因。有些人在工作中遇到這種情況:新的載氣不夠純凈，并且在改變過載氣體后，基線逐漸上升(由于載氣凈化管，基線不會立即改變)。第二天之后，基線非常高，基線抖動很強，所有峰值都很嘈雜，無法檢測到。檢查后，新更換的載氣發生問題，更換載氣后立即恢復正常。
(3)當排除可能導致基線問題的上述原因時，應檢查注射墊是否老化(定期更換注射墊應該是一個好習慣)。
(4)是否應更換石英棉。
(5)襯墊是否清潔。值得一提的是，清洗襯管時，可以用蕞終體積的溶劑充分浸泡，然后超聲波清洗幾分鐘，然后放入高溫爐中，溫度略高于工作溫度，然后重新安裝。
(6)此外，檢測器污染也可能導致基線問題，這可以通過清潔或熱清洗來解決。
