氣相色譜法是利用不同物質在固定相和流動相分配系數的差別，使不同化合物從色譜柱流出的時間不同，以達到分離目的方法，雖然其定量分析效果好，但定性分析比較困難；質譜法則是一種有著優良的定性分析能力，但在復雜有機化合物分析上稍顯薄弱的一種方法。為了更好地分析有機化合物，研究人員將氣相色譜儀和質譜儀聯合起來，繼而產生了能為化學家及生物化學家提供一個可以進行復雜有機化合物高效的定性、定量分析方法——氣質聯用儀。氣相色譜-質譜聯用儀的接口連接色譜儀和質譜儀，是儀器正常運行的關鍵，而其作用包括有：
1.壓力匹配：質譜離子源的真空度在10-3Pa，而GC色譜柱接口的作用就是要使兩者壓力匹配。
2.組分濃縮：從GC色譜柱流出的氣體中有大量載氣，接口的作用是排除載氣，使被測物濃縮后進入離子源。
氣相色譜-質譜聯用儀常見的接口有以下幾種。
1.分子分離器連接(主要用于填充柱)：擴散型——擴散速率與物質分子量的平方成反比，與其分壓成正比。當色譜流出物經過分離器時，小分子的載氣易從微孔中擴散出去，被真空泵抽除，而被測物分子量大，不易擴散則得到濃縮。
2.直接連接法(主要用于毛細管柱)：在色譜柱和離子源之間用長約50cm，內徑0.5mm的不銹鋼毛細管連接，色譜流出物經過毛細管全部進入離子源，這種接口技術樣品利用率高。
3.開口分流連接：該接口是放空一部分色譜流出物，讓另一部分進入質譜儀，通過不斷流入清洗氦氣，將多余流出物帶走。此法樣品利用率低。
