氣質聯用儀是一種將氣相色譜儀和質譜儀聯合起來使用的儀器，故而其結構中擁有質譜儀或者是色譜儀的關鍵部件，包括有離子源、濾質器、檢測器等。
其中，離子源在氣質聯用儀中起著重要的接受樣品產生離子的作用，常用的離子化方式有：
1、電子轟擊離子化：電子轟擊離子化簡稱EI，是最常用的一種離子源，有機分子被一束電子流(能量一般為70eV)轟擊，失去一個外層電子，形成帶正電荷的分子離子(M+)，M+進一步碎裂成各種碎片離子、中性離子或游離基，在電場作用下，正離子被加速、聚焦、進入質量分析器分析。但本法不適合于高分子量和熱不穩定的化合物。
電子轟擊離子化的特點為：結構簡單，操作方便；圖譜具有特征性，化合物分子碎裂大，能提供較多信息；所得分子離子峰不強，有時不能識別。
2、化學離子化：化學離子化簡稱CI，是將反應氣(甲烷、異丁烷、氨氣等)與樣品按一定比例混合，然后進行電子轟擊，甲烷分子先被電離，形成一次、二次離子，這些離子再與樣品分子發生反應，形成比樣品分子大一個質量數的(M+1) 離子，或稱為準分子離子。準分子離子也可能失去一個H2，形成(M-1)離子。
化學離子化的特點為：不會發生象電子轟擊離子化中那么強的能量交換，較少發生化學鍵斷裂，譜形簡單；分子離子峰弱，但(M+1) 峰強，可以提供分子量信息。
3、場致離子化：場致離子化適用于易變分子的離子化，如碳水化合物、氨基酸、多肽、抗生素、苯丙胺類等，能產生較強的分子離子峰和準分子離子峰。
4、場解吸離子化：用于極性大、難氣化、對熱不穩定的化合物。
5、負離子化學離子化：是在正離子MS的基礎上發展起來的一種離子化方法，其給出特征的負離子峰，具有很高的靈敏度(10-15g)。
