近年來，在HPLC基礎上發展出了新型色譜技術，包括低壓液相色譜(LPLC)、中壓液相色譜(MPLC)以及快速蛋白液相色譜(FPLC)，在這些新型色譜技術當中，快速蛋白液相色譜(FPLC)可以非常迅速地分離復雜混合物，能夠在短時間內對大量樣品加以純化。其特性表現為較大的容量、較高的回收效率以及不易失活的生物大分子等。能夠越來越廣泛地使用于生命科學研究及藥物生產上。
FPLC全稱為快速蛋白液相色譜（Fast protein liquid chromatography），其原理與高效液相色譜理論類似，是由經典的液體柱層析引入氣相色譜理論，并且對相體進行了改革，配用高壓輸液泵，采用高靈敏檢測器、梯度洗脫裝置、自動收集裝置和微機等發展起來的現代液相色譜。
HPLC與FPLC的異同
FPLC與HPLC的相同點：
輸液泵、高靈敏檢測器、梯度洗脫裝置、自動收集裝置和計算機控制等設備均為FPLC與HPLC所采用，快速、分辨率高、分離效能高等特點FPLC與HPLC也均具備。
FPLC與HPLC的不同點：
由耐高壓的塑料管組成FPLC的管道系統，由柱塞式泵驅動流動相，中低壓，使用內徑較大的色譜柱，分析精度較高，0～100 mL/min(zui大流速可達1 000 mL/min)為流速范圍，分析精度低于HPLC，僅使用常規無機鹽溶液，對于大規模純化樣品非常適用。
HPLC的管道系統所采用的材料大都為金屬，往復泵或隔膜泵一起驅動流動相，高壓，使用內徑較小的色譜柱，有較高的分析精度，流速蕞大一般不高于20 mL/min(有些制備級HPLC能夠達到300 mL/min)，有時一定濃度的有機溶劑需要被使用，對于微量樣本檢測或少量純化制備君適用。
采用HPLC來對生物大分子分離純化時，因為液相載體通常是有機溶劑，容易變性失活生物大分子，使得生物大分子的回收率降低。同時，采用非惰性的不銹鋼來對HPLC系統的流通線路進行制造，金屬離子工作狀態下可能會發生解離，從而對某些蛋白質組分吸附。
FPLC的層析柱為耐高壓的有機玻璃管，用耐高壓的非金屬材料制成其它管道，同時采用惰性液相載體，能夠使蛋白組分安全快速地分離。所以FPLC對HPLC的操作簡易、重復性強、分離速度快等特點加以保留，并且在生物大分子分離純化過程中分辨率和實用性更加的高。FPLC有其專用預裝柱，分子篩、離子交換、疏水層析等各類層析柱也配備了，廣泛應用于生物學、化學和環境科學等領域。
