近年來，伴隨著食品、醫藥等其它行業檢測技術的不斷進步，乳制品的檢測技術也得到了長足發展。對于乳制品中經常出現的農藥及獸藥殘留、重金屬殘留的問題，都已經有了相當規范的檢測方法和體系。
農藥及獸藥殘留
在很多不合格的食品檢測中，農獸藥殘留都是一個揮之不去的陰影。農藥獸藥殘留問題不僅影響農業生產，同樣影響著乳制品。農業生產過程中常常會發生病蟲草害，所以就需要用利用農藥來進行預防和救治，這也是無法避免的，但由于一些人缺乏對農藥殘留問題的科學認知，過度使用農藥，污染了土地和作物，進而影響到乳及乳制品的安全性。另一方面，一些奶戶為了提高奶牛的抵抗力，違法使用過量的獸藥和各種抗生素，這都是農獸藥殘留超標的重要原因。
乳制品中農獸藥殘留的檢測方法有傳統微生物檢測法、免疫檢測法、理化檢測法、TTC法等，理化檢測方法是利用相關的儀器對樣品進行定性定量分析，具有快速準確的優勢，現已成為乳制品及各種食品主要的檢測方法。液相色譜、氣相色譜一質譜聯用儀和液相色譜一質譜聯用儀等就是理化檢測中通常會用到的儀器。
重金屬污染
重金屬污染是由于奶牛攝入、飲用重金屬含量較多的飼料和水，將其代謝到牛奶中而形成的。在乳制品的重金屬污染中，鉛、鉻、鎘、汞以及砷等具有明顯生物毒性的重金屬都是被人們廣泛所關注的，這些物質進入人體后會產生生物富集現象，慢慢危害人體健康。因此，對于乳制品的重金屬元素進行檢測是非常必要的。目前，測定乳制品中重金屬的常見方法有膠體金免疫層析法、分光光度法、原子吸收法和電感耦合等離子體質譜檢測法等。
無論是在乳制品的重金屬檢測中還是在農獸藥殘留檢測中，檢測前都要對樣本進行前處理，以消除基質干擾、保護儀器，提高樣品檢測方法的靈敏度和準確性，實驗中常用的固相萃取技術、固相微萃取技術、分子印跡技術、凝膠層析及加速溶劑提取等技術，都可以對乳制品進行高效快速的前處理，為檢測工作做好準備。
不可否認的是，乳制品在我們日常的飲食結構中還是占了相當一部分比例的，但同時它也是較容易出現安全事故的食品之一。所以為了國民的安全考慮，利用各種先進技術和設備把控乳制品品質，清除我國乳業的“不安全”標簽，仍然是我國乳制品監管行業的重任。
乳制品是我們飲食結構中比較重要的一部分，尤其是對于嬰幼兒和兒童來說，因此保障乳制品質量安全是十分必要的。當前，隨著各類檢測分析儀器的不斷發展，有越來越多的儀器設備可以用于乳制品質量檢查，這對于我國的食品安全和乳制品行業發展來說都是一大喜訊。
